Несмотря на то что томаты менее требовательны к обеспеченности водой по сравнению с огурцами и способны переносить кратковременную засуху, для полноценного плодоношения они должны быть обеспечены влагой в достаточном количестве в постоянном режиме.
Виды томатов, введённые человеком в культуру, изначально обитали в Эквадоре, Перу и на севере Чили в достаточно засушливых районах, где грунтовые воды залегают на не доступных корням растений глубинах. Поэтому томат имеет поверхностную корневую систему и при поливе следует стремиться поддерживать умеренно увлажнённым (на уровне 75% от полной полевой влагоёмкости) лишь корнеобитаемый слой земли на глубину не более 30 см. Слишком обильные поливы только обедняют почву питательными веществами и создают для корней томата условия недостаточности кислорода воздуха.
Поливать томаты следует после 18 часов отстоянной, нагревшейся за день водой. Благодаря этому устьица на листьях растений остаются широко открытыми всю ночь и в ткани листьев проникает количество углекислого газа, достаточное для полноценного фотосинтеза в течение всего светового дня. Поливают строго под корень, избегая намокания стебля и листьев.
Пыльца у томатов крупная и тяжёлая. Из раскрытых пыльников она падает почти вертикально вниз прямо на рыльце. Происходит это ещё до распускания цветков. У сортов томата с крупными многокамерными плодами цветки отличаются от обычных. Они имеют гораздо больше лепестков и больше тычинок. Пестик у таких сортов широкий, неправильной формы, с крупным бугорчатым рыльцем, расположенным на уровне тычиночной колонки. В завязи не одна, а неопределённое множество семяпочек. Пыльца в пыльниках упакована более плотно, многие пыльцевые зерна стерильны.
В результате этих особенностей часто бывает, что пыльца высыпается не из всех пыльцевых мешочков, попадает на бугорки рыльца неравномерно. При воздействии неблагоприятных условий (похолодание, засуха и т.п.) это ведет к неполному опылению, многие семяпочки завязи остаются неоплодотворенными и, как следствие, часть неопыленных цветков опадает, часть плохо опыленных дает уродливые плоды, снижаются урожайность и качество продукции.
В тихую погоду пыльца может падать вообще мимо пестика. А в защищённом грунте, где ветра вообще нет, это происходит сплошь и рядом. Насекомые цветки томатов почти не посещают, так что для полного оплодотворения цветков нужно потрудиться садоводу. Растения нужно осторожно, но энергично встряхнуть, чтобы пыльца попала на рыльце со всех сторон. Обычно это принято делать с помощью палки с обмотанным тканью концом. Ею несильно ударяют несколько раз по основанию куста.
Для повышения урожайности томаты следует собирать бланжевыми, не дожидаясь их созревания. Сбор томатов рекомендуется производить вечером, чтобы ночью растения расходовали накопленные в тканях пластические вещества на увеличение массы новых плодов, а не на созревание уже готовых к сбору. Это даёт прибавку урожая в 4–5%.