Клубневую бегонию выкапывают из грунта после первых осенних заморозков, когда поникает наземная часть растений. Стебли обрезают, оставляя пеньки высотой 2-3 см, а клубни подсушивают в течение 2 недель при температуре 18-20 град.. Затем землю отряхивают, удаляют остатки стеблей и засыпают клубни чистым песком. В таком виде их можно хранить в темном прохладном месте, например в погребе или в холодильнике, вплоть до весны.
В конце марта — начале апреля клубни очищают от песка и старых корней, дезинфицируют в течение 1 часа в растворе марганцовокислого калия и высаживают для подращивания в ящики или торфоперегнойные горшочки с рыхлой питательной землей.
Клубневая бегония очень теплолюбива, поэтому переносить ее в грунт можно только тогда, когда минует опасность поздних весенних заморозков.