Разные сорта всегда всходят неодновременно. Это, можно сказать, сортовая особенность отдельных сортов. Даже более того, есть некоторые сорта, для которых характерна не только невысокая всхожесть, но и большой процент невыполненных семян. Это не аномалия, а просто особенность, причем даже хозяйственно полезная, ведь чем меньше семян, тем больше в плодах мякоти. Разве что это может расстроить тех, кто выращивает томаты на семена (но обычно это компенсируют более высокой ценой на семена таких сортов).
Также всхожесть зависит от вызревания семян в целом и их просушки. Те, что более пересушены или дольше хранились, всегда всходят позже. Обычно все различия между ранними и поздними всходами к моменту высадки рассады становятся незаметны, а при условии правильного выращивания рассады поздние всходы дадут нормальный урожай.